面对这样的竞争态势，管理的系统性和敏捷性就显得非常重要，这需要良好的信息系统来保障。如果说信息系统是传统企业的重要管理手段的话，对于电商则无疑具有决定性意义。
据周建军了解，部分电商的财务系统建设还比较落后，管理缺乏体系性，也缺乏延续性的财务基础，企业的管理更多靠管理者的勤勉。在他看来，这种管理方式销售额可能做到100亿，但是超100亿且要保持高速发展是不可能的，企业文化治理是非常迫切的，但同时应该要做系统化建设，否则就不可持续做大做强。
同时他也强调一点，电商的财务系统与传统企业也有所不同。零售行业的财务系统至关重要，电子商务的特点是业务创新性非常高，财务的规范化建设可能会制约业务发展，从而会影响业务的突破和创新，因为电商业务形式多样，并且不断在变化，这个矛盾很难解决，需要在信息系统中去平衡，这也是传统行业做不了电商的原因之一。现在电商的财务系统都做成开口化的设计，业务新增时都是以开放的方式接受，而传统系统添加新业务则很难。
电商需要的是一个成熟的软件来同时支持零售和财务。过去零售商可以用设计商品编码的方法来进行管理，资金方面可以用POS机来规范，而电子商务前端都是数据分析的东西，后端与财务系统对接较难，传统零售有标准的业务流，而电子商务没有这样的标准，各个软件的逻辑和数据源无法对接，就需要人工来梳理。如果是垂直电商的话，逻辑相对简单，一般传统业务模式可以套进去，但是像当当这种综合电商就比较复杂。比如传统零售会有扣点、促销费用，这些都形成标准化来，来自过去十几年来的总结，各地渠道的模式都是可以套用的。现在电子商务品类全方面、覆盖更广，比如图书有码洋（图书标价）和实洋，一段时间可能价格会有多次变化，而且还有不同的渠道和促销活动，相应的有不同的确认和结算方法，对于电商是一个很大的挑战。实践中，电商往往把有限的精力集中在业务前端与客户的交互系统上，后端的数据管理则相对乏力。也有的电商已经着手搭建系统的信息平台，但是进展并不顺利，比如某团购网站用Oracle系统半途而废，某知名电商花费1.2个亿，历时25个月的系统仍不能顺利运行。即便如此，周建军认为，未来电商财务管理的提升还是要靠系统建设，只是要找到业务创新的平衡点。
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